
pdb2mrc -i 1atn.pdb -o 1atn.mrc -Sx 50 -Sy 15 -Sz 30 -nx 20 -ny 20 -nz 20 -dx 5 -dy 5 -dz 5 -w 1 -sig 5

pdb2mrc -i 1atn.pdb -o 1atn.mrc2 -Sx 50 -Sy 15 -Sz 30 -nx 50 -ny 50 -nz 50 -dx 2 -dy 2 -dz 2 -w 1 -sig 2 

pdbMove -i 1atn.pdb -o 1atn.pdbtrans -x -9.337624e+01 -y -5.473401e+01 -z -6.938094e+01

pdbRotation -i 1atn.pdbtrans -o 1atn.pdbtrans2 -ZYX 10 20 30  
